| 17.12.20162016-12-17 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 19. R | SC Paderborn - VFL Osnabrück | -:- |
| 10.12.20162016-12-10 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 18. R | Preußen Muenster - SC Paderborn | -:- |
| 3.12.20162016-12-3 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 17. R | FSV Zwickau - SC Paderborn | 3:0 (1:0) |
| 26.11.20162016-11-26 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 16. R | SC Paderborn - Fortuna Koeln | 1:1 (0:1) |
| 19.11.20162016-11-19 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 15. R | Sportfreunde Lotte - SC Paderborn | 6:0 (3:0) |
| 5.11.20162016-11-5 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 14. R | SC Paderborn - VFR Aalen | 0:0 (0:0) |
| 29.10.20162016-10-29 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 13. R | FSV Frankfurt - SC Paderborn | 3:0 (2:0) |
| 22.10.20162016-10-22 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 12. R | SC Paderborn - Hallescher FC | 0:0 (0:0) |
| 17.12.20162016-12-17 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 17. R | St. Pauli - VFL Bochum | -:- |
| 11.12.20162016-12-11 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 16. R | Greuther Fürth - St. Pauli | -:- |
| 2.12.20162016-12-2 18:30:00 | 18:30 | 2. Bundesliga | 15. R | St. Pauli - Kaiserslautern | 0:0 (0:0) |
| 26.11.20162016-11-26 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 14. R | FC Heidenheim - St. Pauli | 2:0 (1:0) |
| 20.11.20162016-11-20 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 13. R | St. Pauli - Fortuna Düsseldorf | 0:1 (0:1) |
| 7.11.20162016-11-7 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 12. R | Wuerzburger Kickers - St. Pauli | 1:0 (0:0) |
| 31.10.20162016-10-31 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 11. R | St. Pauli - 1. FC Nürnberg | 1:1 (1:1) |
| 25.10.20162016-10-25 20:45:00 | 20:45 | DFB Pokal | 2. R | St. Pauli - Hertha BSC | 0:2 (0:1) |