| 11.12.20162016-12-11 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 14. R | MGladbach - Mainz 05 | -:- |
| 8.12.20162016-12-8 19:00:00 | 19:00 | Europa League Grp. C | 6. R | Mainz 05 - FK Qabala | -:- |
| 2.12.20162016-12-2 20:30:00 | 20:30 | 1. Bundesliga | 13. R | Mainz 05 - Bayern München | 1:3 (1:2) |
| 27.11.20162016-11-27 17:30:00 | 17:30 | 1. Bundesliga | 12. R | Hertha BSC - Mainz 05 | 2:1 (1:1) |
| 24.11.20162016-11-24 21:05:00 | 21:05 | Europa League Grp. C | 5. R | Saint-Etienne - Mainz 05 | 0:0 (0:0) |
| 19.11.20162016-11-19 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 11. R | Mainz 05 - Freiburg | 4:2 (2:0) |
| 6.11.20162016-11-6 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 10. R | RasenBallsport Leipzig - Mainz 05 | 3:1 (3:0) |
| 3.11.20162016-11-3 19:00:00 | 19:00 | Europa League Grp. C | 4. R | Anderlecht - Mainz 05 | 6:1 (2:1) |
| 17.12.20162016-12-17 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 17. R | St. Pauli - VFL Bochum | -:- |
| 11.12.20162016-12-11 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 16. R | Greuther Fürth - St. Pauli | -:- |
| 2.12.20162016-12-2 18:30:00 | 18:30 | 2. Bundesliga | 15. R | St. Pauli - Kaiserslautern | 0:0 (0:0) |
| 26.11.20162016-11-26 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 14. R | FC Heidenheim - St. Pauli | 2:0 (1:0) |
| 20.11.20162016-11-20 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 13. R | St. Pauli - Fortuna Düsseldorf | 0:1 (0:1) |
| 7.11.20162016-11-7 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 12. R | Wuerzburger Kickers - St. Pauli | 1:0 (0:0) |
| 31.10.20162016-10-31 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 11. R | St. Pauli - 1. FC Nürnberg | 1:1 (1:1) |
| 25.10.20162016-10-25 20:45:00 | 20:45 | DFB Pokal | 2. R | St. Pauli - Hertha BSC | 0:2 (0:1) |