| 17.12.20162016-12-17 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 15. R | Werder Bremen - 1. FC Köln | -:- |
| 10.12.20162016-12-10 18:30:00 | 18:30 | 1. Bundesliga | 14. R | Hertha BSC - Werder Bremen | -:- |
| 3.12.20162016-12-3 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 13. R | Werder Bremen - Ingolstadt 04 | 2:1 (1:0) |
| 26.11.20162016-11-26 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 12. R | Hamburger SV - Werder Bremen | 2:2 (2:2) |
| 20.11.20162016-11-20 17:30:00 | 17:30 | 1. Bundesliga | 11. R | Werder Bremen - Eintracht Frankfurt | 1:2 (1:0) |
| 6.11.20162016-11-6 17:30:00 | 17:30 | 1. Bundesliga | 10. R | Schalke 04 - Werder Bremen | 3:1 (2:1) |
| 29.10.20162016-10-29 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 9. R | Werder Bremen - Freiburg | 1:3 (0:2) |
| 23.10.20162016-10-23 15:30:00 | 15:30 | 1. Bundesliga | 8. R | RasenBallsport Leipzig - Werder Bremen | 3:1 (1:0) |
| 8.12.20162016-12-8 21:05:00 | 21:05 | Europa League Grp. G | 6. R | Panathinaikos - Celta Vigo | -:- |
| 24.11.20162016-11-24 19:00:00 | 19:00 | Europa League Grp. G | 5. R | Ajax - Panathinaikos | 2:0 (1:0) |
| 3.11.20162016-11-3 21:05:00 | 21:05 | Europa League Grp. G | 4. R | Panathinaikos - Standard Lüttich | 0:3 (0:0) |
| 20.10.20162016-10-20 19:00:00 | 19:00 | Europa League Grp. G | 3. R | Standard Lüttich - Panathinaikos | 2:2 (1:2) |
| 29.9.20162016-9-29 19:00:00 | 19:00 | Europa League Grp. G | 2. R | Celta Vigo - Panathinaikos | 2:0 (0:0) |
| 15.9.20162016-9-15 21:05:00 | 21:05 | Europa League Grp. G | 1. R | Panathinaikos - Ajax | 1:2 (1:1) |
| 25.8.20162016-8-25 19:00:00 | 19:00 | Europa League Qualification | Finale | Broendby IF - Panathinaikos | 1:1 (1:0) |