| 17.12.20162016-12-17 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 19. R | Sportfreunde Lotte - Magdeburg | -:- |
| 10.12.20162016-12-10 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 18. R | Magdeburg - VFR Aalen | -:- |
| 4.12.20162016-12-4 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 17. R | FSV Frankfurt - Magdeburg | 0:1 (0:1) |
| 26.11.20162016-11-26 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 16. R | Magdeburg - Hallescher FC | 1:0 (1:0) |
| 19.11.20162016-11-19 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 15. R | Sonnenhof Großaspach - Magdeburg | 1:3 (1:2) |
| 5.11.20162016-11-5 14:10:00 | 14:10 | 3. Liga | 14. R | Magdeburg - Hansa Rostock | 1:1 (1:0) |
| 29.10.20162016-10-29 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 13. R | Jahn Regensburg - Magdeburg | 1:1 (0:0) |
| 22.10.20162016-10-22 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 12. R | Magdeburg - Chemnitzer FC | 2:4 (0:2) |
| 17.12.20162016-12-17 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 19. R | Jahn Regensburg - Preußen Muenster | -:- |
| 10.12.20162016-12-10 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 18. R | Chemnitzer FC - Jahn Regensburg | -:- |
| 2.12.20162016-12-2 18:35:00 | 18:35 | 3. Liga | 17. R | Jahn Regensburg - RW Erfurt | 0:1 (0:0) |
| 26.11.20162016-11-26 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 16. R | Holstein Kiel - Jahn Regensburg | 2:1 (0:0) |
| 19.11.20162016-11-19 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 15. R | Jahn Regensburg - SV Wehen | 3:1 (1:1) |
| 5.11.20162016-11-5 14:00:00 | 14:00 | 3. Liga | 14. R | Werder Bremen II - Jahn Regensburg | 3:1 (0:0) |
| 29.10.20162016-10-29 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 13. R | Jahn Regensburg - Magdeburg | 1:1 (0:0) |
| 23.10.20162016-10-23 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 12. R | Mainz 05 II - Jahn Regensburg | 2:0 (1:0) |